Посидел покурил докуху по Doctrine 2, пришел к выводу что до офф. интеграции второй версии еще долековато, вернее они во второй версии движутся в противоположную сторону структуры ZF.
Бесспорно задумка с описанием моделей и инстенсов очень даже ничего, но если это задумывалось использовать в будущем с ZF, то они немного перестарались с namespace-ами, имхо как-то не читабельно и не так удобно как в ZF.
В прочем для себя решил пока заюзать Doctrine 1.2, она таки удачно интегрируется с ZF 1.9, несколько строк в бутстрапе и вуаля..
Ну короче это мой вывод по топику....